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一種從熱帶木本植物中無毒組織研磨提取核酸的方法

發(fā)表時間：2019/12/19

木本熱帶植物中含有大量復(fù)雜的有機(jī)化合物，這些有機(jī)化合物會抑制提取RNA或DNA所需的化學(xué)程序，從而不利于后續(xù)研究及應(yīng)用，如RNA測序和基因表達(dá)分析。為了克服這個問題，研究人員必須使用CTAB / PVP緩沖液的提取方案，而不能使用市售的DNA / RNA提取試劑盒。但是，這種提取方式耗時長、需使用有毒化學(xué)品（例如苯酚和CHCl₃），并且一次只能處理少量樣品。為了克服這些問題，我們開發(fā)了一種基于CTAB / PVP的新方法，用于RNA或DNA提取，去掉了傳統(tǒng)方法中的苯酚/CHCl₃步驟。此外，該方法同樣適用于96孔深孔板，使用SPEX高通量組織研磨儀，一次研磨6塊深孔板，同時處理576個樣品，大大加快了處理速度。

我們的新方法，能夠從夏威夷果、牛油果和芒果組織中，成功提取RNA，這些組織使用傳統(tǒng)方法很難提取到RNA。而后我們還驗(yàn)證了，該方法提取的RNA成功地合成cDNA，以進(jìn)行實(shí)時定量PCR并生成高質(zhì)量的RNA-Seq庫。該方法經(jīng)輕微改動后，可用于從不同的熱帶和亞熱帶樹種中快速提取DNA。

這種方法可以更安全、更快速地從困難樣品中提取DNA和RNA，從而為將來在熱帶樹木上的研究提供了便利。